先給答案
選擇性培養基靠抑制劑（膽鹽、染劑、抗生素、高鹽、亞碲酸鹽）壓住不要的菌，靠指示劑讓目標菌顯色。失效分兩種：「不該長的長了」多半是抑制劑失效，原因是滅菌過頭、配製後放太久、或該在滅菌後加的補充物沒加；「該長的沒長」多半是抑制太強或營養不夠，原因是補充物加錯量、平板太乾、或目標菌本身受傷。兩種都用標準菌株的平行測試可以在一天內判定是培養基還是檢體的問題。
不該長的長了：抑制劑失效
- 滅菌過頭：膽鹽、結晶紫、煌綠、中性紅這些成分對熱敏感，121°C 15 分鐘是上限，重複滅菌或大瓶裝加熱時間過長，抑制力就掉。說明書寫「煮沸溶解、不可高壓滅菌」的培養基（m-Endo、部分顯色培養基）更不能進滅菌鍋。
- 補充物沒加或加錯：Baird-Parker 要加蛋黃亞碲酸鹽、MYP 要加多粘桿菌素、Oxford 要加抗生素補充物。基礎培養基本身沒有選擇性，漏加就什麼都長。
- 配製後放太久：含染劑和抗生素的平板，冷藏超過一到兩週抑制力會下降；抗生素補充物加進去之後的有效期更短，照說明書。
- pH 偏離：pH 太低時，MacConkey 的膽鹽抑制力變弱；滅菌後 pH 掉太多要回頭看配製。
- 接種量太大：檢體菌量過高時，抑制劑是「減少」不是「殺光」，雜菌一樣會長出來。稀釋後再接種。
該長的沒長：抑制過強或營養不足
- 補充物過量：抗生素、亞碲酸鹽多加一倍，目標菌也會被壓。用定量方式加，不要用「大概幾滴」。
- 平板太乾或太老：表面脫水的平板，受傷的目標菌長不起來，雜菌反而有機會。
- 目標菌受傷：經過加熱、冷凍、酸處理的檢體，菌需要先在非選擇性培養基或增菌液復甦，直接上選擇性培養基會被抑制劑殺掉。這是檢驗方法裡「前增菌」存在的理由。
- 培養條件：溫度、時間、氣體條件（弧菌、曲狀桿菌各有要求）不對，目標菌長不出來不是培養基的錯。
用標準菌株判定
每一種選擇性培養基都有規定的性能測試菌株，包含「應該長而且顯色正確」的目標菌和「應該被抑制」的非目標菌。例如：
| 培養基 | 應該長 | 應該被抑制 |
|---|---|---|
| MacConkey Agar | E. coli（紅色）、Salmonella（無色） | S. aureus、Enterococcus |
| Baird-Parker | S. aureus（黑色、有透明環） | E. coli、Bacillus |
| XLD | Salmonella（紅色、黑心） | E. coli（黃色）、S. aureus |
| TCBS | Vibrio parahaemolyticus（綠）、V. cholerae（黃） | E. coli |
| Cetrimide | Pseudomonas aeruginosa（螢光） | E. coli、S. aureus |
做法：新配的培養基與有問題的培養基各接種目標菌與非目標菌，和檢體平行培養。有問題的平板如果非目標菌也長了，就是培養基失效；如果標準菌株表現正常、只有檢體異常，問題在檢體。ISO 11133 對這個測試有完整規定，檢驗室的品質系統通常要求每批培養基都要做。
什麼時候該重配
- 標準菌株測試不合格：整批丟掉重配，並查原因（滅菌紀錄、補充物批號與加入量、水質）。
- 平板超過保存期限、表面有裂痕或脫水、顏色跟平常不一樣：不要用。
- 粉末開封後結塊或變色：見粉末培養基結塊變色還能用嗎。
常見問題
基礎培養基和完整培養基差在哪？ 「基礎」是滅菌後還要加補充物（蛋黃、血液、抗生素、亞碲酸鹽）才完整的培養基，因為這些補充物不耐熱。產品名有 Base 的都是這一類，說明書會寫加什麼、加多少、什麼溫度加。
顯色培養基的顏色很淡，是培養基的問題嗎？ 先看培養時間夠不夠（多數顯色反應要 24 小時才明顯）、平板有沒有避光保存（顯色受質見光會分解）。都沒問題再測標準菌株。
可以自己加抗生素做選擇性培養基嗎？ 可以，但抗生素的種類、濃度、加入溫度要照方法，而且加了之後的有效期很短。方法裡有規定的補充物，用商品化的補充物比較穩定。
上鼎的選擇性培養基有附性能測試資料嗎？ 每批附 COA，含標準菌株的培養性能結果；需要完整的性能測試報告可以索取。產品頁的「台灣公告檢驗方法」區塊也寫明了每支培養基在哪個方法扮演什麼角色，見依標準方法找培養基。